Já se sabe o que acontece quando os super-heróis se tornam maus, mas nem todos começam por ser corruptos. O problema é que quando os estudantes competem por popularidade e boas notas, a qualquer custo, é evidente que os riscos serão muito maiores quando há superpoderes envolvidos.

Na segunda temporada, há todo um novo currículo escolar preparado para estes jovens. Enquanto o resto da América se ajusta ao tirânico (e psicopata) punho de ferro de Homelander, na Universidade Godolkin o misterioso novo diretor promove um plano de estudos que promete tornar os alunos mais poderosos do que nunca.

Cate e Sam são celebrados como heróis, enquanto Marie, Jordan e Emma voltam relutantemente para a universidade, carregando um peso de meses de trauma e de perdas pessoais. Mas ficar preocupado com festas e as aulas torna-se difícil, e nem faz muito sentido, quando uma guerra entre humanos e super-humanos se está a iniciar dentro e fora do campus.

Para mais, o grupo de amigos descobre a existência de um programa secreto que remonta à fundação da Godolkin e que pode ter implicações muito maiores do que imaginam. E, de alguma forma, Marie faz parte dele.